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硅胶破碎法抽提真菌染色体DNA
作者:管理员    发布于:2016-07-26 14:17:21    文字:【】【】【

  硅胶破碎法抽提真菌染色体DNA张桂敏,唐文杰,班静,马立新(湖北大学生命科学学院,湖北武汉430062)学,由可以看出,染色体DNA主带在23kb以上,很少有降解的小碎片。

  3.2抽提真菌染色体DNA的紫外吸收光谱测定经亚精胺纯化的DNA经稀释后进行紫外吸收光谱测定,其紫外吸收A260/A280比值为1.823,DNA产量可稳定在0. 3染色体DNA酶切效果将抽提并纯化的3种DNA,分别用3种平端限制性内切酶进行酶解,酶解效果见的2~10泳道。电泳结果显示酶解后的DNA片段从大到小分布均,说明DNA能被限制酶有效的切开。

  3.4PCR扩增结果用ITS1和ITS4引物对3种DNA进行PCR扩增,扩增产物经电泳,均在500bp附近呈现清晰的条带,扩增效果见。

  4讨论近20年来,真菌分子生物学研究取得了许多进展,人们开始从真菌中获得基因资源或者研究基因的功能,在已知目的基因片段的前提下,利用GWPCR法克隆真菌基因,克服了RACE克隆方法5‘端效率不高的问题,更简便易行,但是如果没有大量高质量的DNA,这种方法就会因多次测序而增加成本。因此,发展简便易行的真菌高质量染色体DNA提取方法至关重要,目前存在和使用的丝状真菌染色体DNA提取方法步骤大体相似,差别主要在于采用什么方法破坏丝状真菌细胞壁和如何对DNA进行纯化。在破壁方面主要采用液氮研磨破壁,酶解形成原生质体法,玻璃珠机械破壁法以及氯化苄法等;在DNA纯化上,比较简便的有苯酚/氯仿法和LiCl法,但是上述抽提总DNA主要是做PCR的模板或者做Southern印迹,对DNA的量和纯度要求不高。

  我们在和使用这些不同提取方法的基础上,主要从提高所得DNA样品的质量和产量两个方面进行改进,利用国产硅胶代替进口玻璃珠并与液氮冷冻研磨破菌结合起来,提高了破菌效率,能稳定地得到大量的DNA,不仅适用于丝状真菌,同样适用于平菇等大型真菌;在DNA的纯化方面采取亚精胺法取得了良好的效果。

  采用该方法所获得的高分子量DNA在进行基因组步行PCR时,所得PCR产物一次测序就是目的片段,而没用亚精胺法纯化的DNA在进行步行时往往要重复几次测序才能得到目的片段。另外碑开究发展的抽提真菌总DnA的方法r除特别适晶于mGWe.法克隆基因,也完全适于进行其它各类分子生物学研究工作。

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